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赛默飞世尔科技(中国)有限公司

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公司动态
ASTRAL客户之声| 高通量与高深度兼得,拓展蛋白质分析的极限
发布时间:2023-12-03        浏览次数:165        返回列表
 原创 飞飞 赛默飞色谱与质谱中国

关注我们,更多干货惊喜好礼

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导语:

赛默飞在2023年ASMS上发布的Orbitrap Astral超高分辨质谱仪,一经问世立即引起了国内学界的广泛关注。随之,众多行业精英纷纷订购这一划时代的革命性产品。随着shou批用户的装机,相关实测数据陆续发布。为此我们精心汇总了shou家用户—诺禾致源所揽获的实测数据,从细胞到血浆,从植物到动物,这款革命性的质谱仪以其无与lun比的性能,quan方位刷新了学界对质谱仪的认知。

 

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01

Hela细胞--180 runs/天,

真正的高通量分析时代已经来临

采用Orbitrap Astral高分辨质谱仪对Hela细胞裂解液样本进行分析,分别测试8 min、15 min、24 min 的时间梯度。结果显示,8 min 梯度(包括上样、平衡、洗脱、有效分析时间的总时长)下蛋白质鉴定数目可达8,000+。这意味着每天可实现180个样本的分析通量,运行成千上万样本的大队列分析可成为每个蛋白质组学实验室的日常。真正的高通量分析时代已经来临!

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在24 min梯度下,鉴定数目可轻松达到 10,000+,实现更高深度的覆盖。该测试结果不仅相较HF-X(1μg上样量,90分钟梯度)的分析深度(7285个蛋白)得到了3400+新的蛋白质定性数据,而且可覆盖HF-X数据的98.5%。这意味着采用Astral分析平台,不仅可以重现以往深度分析的鉴定结果,还使分析效率提升了3-4倍,同时获得了更的鉴定效果。Astral多快好省助力蛋白质组学高深度分析。

 

02

血浆-短梯度蛋白分析深度新突破

以往,血浆蛋白质组的复杂性限制了大规模、无偏的蛋白质组学研究。使用Orbitrap Astral高分辨质谱仪,对不同血浆蛋白质组学研究方法的性能进行了比较,得到了前suo未有的优异结果。通过去除高丰度蛋白,显著增加了分析的深度。仅使用500 ng血浆蛋白量,在24min梯度下鉴定数目就可以超过1,200个,血浆蛋白鉴定数目提升45%。这一发现使得在精简的工作流程基础上,实现血浆蛋白质组学高深度、广覆盖的研究成为现实。

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03

植物组织-一针上样穷尽拟南芥蛋白定性结果成为可能

采用非数据依赖性数据采集模式(DIA), Orbitrap Astral 质谱仪实现了拟南芥样本的高深度分析。其中,拟南芥叶样本蛋白鉴定数目达到11,195,根茎样本蛋白鉴定数目达到12,781。值得注意的是,与 2020 年Nature公开发表的拟南芥蛋白质深度分析数据相比,本次在 Astral 平台仅通过2种拟南芥样本,3次重复,在短短24min梯度分析中得到的蛋白分析结果,即可覆盖30种拟南芥组织公开数据80%以上的蛋白。这表明通过 Astral 质谱仪,或可实现仅通过单针上样即可基本穷尽样本蛋白质定性结果

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04

动物组织-轻松扩展蛋白质分析的边界

使用 Orbitrap Astral 高分辨质谱仪检测,在小鼠组织样本可在24min梯度轻松实现蛋白鉴定数10,000+,肽段鉴定数目120,000+的优异结果。其中小鼠脑组织样本蛋白鉴定数目为11,204,小鼠睾丸组织样本蛋白鉴定数目12,660,小鼠肾脏组织样本蛋白鉴定数目10,544。这些测试数据进一步刷新和扩展了动物组织样本分析的边界,为广大科研工作者带来更多科技的惊喜和突破!

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的稳定性和定量准确性

在实现上述亮眼测试结果的同时,也对Astral进行了重复性和稳定性测试。对200 ng蛋白含量的Hela细胞裂解液样本进行3次重复进样检测,对所鉴定蛋白CV进行统计,发现3次进样CV<20%的占比为92.7%,CV的中位值是3%(下图左)。

使用Orbitrap Astral 高分辨质谱仪能够精确测定由小鼠脑组织、大肠杆菌和拟南芥多种比例的混合物样本中每种来源的蛋白质比例,表明数据采集具有出色的准确性。该项测试中共鉴定得到 14,153 种蛋白质,包括几乎整个大肠杆菌蛋白质组(下图右)。

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注:文中所有实测数据来自北京诺禾致源生物科技有限公司

诺禾致源(688315)成立12年以来,始终基于用户需求不断探索更多应用场景下的多组学整合解决方案。在蛋白质组和代谢组学研究方面,基于高性能质谱平台以及样本处理全自动化产线,积累了丰富的检测及分析经验。此次引进赛默飞Orbitrap Astral高分辨质谱平台,将助其继续发挥专业优势,以丰富的项目经验、高效稳定的服务为科研工作者赋能。

 

结语

 

在诺禾致源多次测试中,Orbitrap Astral都以令人振奋的性能刷新了质谱分析的能力边界。如下图所示,它将久经考验的 Orbitrap 分析器与的 Astral 分析器相结合,将 Orbitrap超高分辨的优势发挥到ji致的同时,兼具超快的扫描速度和超高的检测灵敏度,集高通量、高覆盖度,及精准定量性于一体。可全方面为DIA(数据非依赖扫描)、PTM(蛋白质翻译后修饰)、TMT18-plex标记定量、单细胞蛋白质组学、大队列分析等领域带来革命性的变革,让我们共同期待中国shou批用户后续更多维度的测试数据。

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